Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCINQ13939 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCINQ13939 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCINQ13939 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCINQ13939 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCINQ13939 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCINQ13939 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCINQ13939 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCINQ13939 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCINQ13939 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCINQ13939 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCINQ13939 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCINQ13939 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCINQ13939 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCINQ13939 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCINQ13939 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCINQ13939 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCINQ13939 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCINQ13939 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCINQ13939 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCINQ13939 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCINQ13939 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCINQ13939 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCINQ13939 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCINQ13939 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCINQ13939 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CCINQ13939 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCINQ13939 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCINQ13939 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCINQ13939 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCINQ13939 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCINQ13939 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCINQ13939 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCINQ13939 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCINQ13939 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCINQ13939 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCINQ13939 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCINQ13939 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCINQ13939 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCINQ13939 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCINQ13939 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCINQ13939 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCINQ13939 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCINQ13939 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCINQ13939 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCINQ13939 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCINQ13939 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCINQ13939 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCINQ13939 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCINQ13939 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCINQ13939 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCINQ13939 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCINQ13939 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCINQ13939 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCINQ13939 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCINQ13939 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCINQ13939 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CCINQ13939 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCINQ13939 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCINQ13939 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCINQ13939 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCINQ13939 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCINQ13939 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCINQ13939 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CCINQ13939 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCINQ13939 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCINQ13939 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCINQ13939 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCINQ13939 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCINQ13939 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCINQ13939 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCINQ13939 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCINQ13939 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCINQ13939 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCINQ13939 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCINQ13939 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCINQ13939 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCINQ13939 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCINQ13939 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCINQ13939 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCINQ13939 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCINQ13939 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCINQ13939 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCINQ13939 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCINQ13939 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCINQ13939 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCINQ13939 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCINQ13939 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCINQ13939 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCINQ13939 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCINQ13939 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCINQ13939 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCINQ13939 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCINQ13939 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCINQ13939 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCINQ13939 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCINQ13939 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CCINQ13939 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCINQ13939 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCINQ13939 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms