Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GCLCP48506 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCLCP48506 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCLCP48506 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCLCP48506 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCLCP48506 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCLCP48506 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCLCP48506 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCLCP48506 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCLCP48506 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCLCP48506 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GCLCP48506 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCLCP48506 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCLCP48506 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCLCP48506 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCLCP48506 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCLCP48506 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCLCP48506 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCLCP48506 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCLCP48506 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCLCP48506 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCLCP48506 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCLCP48506 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCLCP48506 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCLCP48506 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCLCP48506 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCLCP48506 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCLCP48506 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCLCP48506 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCLCP48506 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCLCP48506 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GCLCP48506 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCLCP48506 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCLCP48506 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCLCP48506 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCLCP48506 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCLCP48506 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCLCP48506 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCLCP48506 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCLCP48506 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCLCP48506 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCLCP48506 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCLCP48506 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCLCP48506 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCLCP48506 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCLCP48506 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCLCP48506 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCLCP48506 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GCLCP48506 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCLCP48506 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCLCP48506 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCLCP48506 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCLCP48506 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCLCP48506 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCLCP48506 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCLCP48506 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCLCP48506 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCLCP48506 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCLCP48506 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCLCP48506 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCLCP48506 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCLCP48506 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCLCP48506 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GCLCP48506 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCLCP48506 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCLCP48506 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCLCP48506 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCLCP48506 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCLCP48506 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCLCP48506 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCLCP48506 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCLCP48506 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCLCP48506 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCLCP48506 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCLCP48506 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCLCP48506 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCLCP48506 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCLCP48506 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCLCP48506 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCLCP48506 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCLCP48506 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCLCP48506 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCLCP48506 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCLCP48506 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCLCP48506 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCLCP48506 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCLCP48506 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCLCP48506 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCLCP48506 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCLCP48506 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCLCP48506 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCLCP48506 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCLCP48506 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GCLCP48506 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GCLCP48506 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GCLCP48506 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GCLCP48506 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GCLCP48506 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GCLCP48506 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GCLCP48506 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms