Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LAMC1P11047 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LAMC1P11047 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms