Protein–RNA interactions for Protein: P05160

F13B, Coagulation factor XIII B chain, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13BP05160 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
F13BP05160 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
F13BP05160 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
F13BP05160 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
F13BP05160 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
F13BP05160 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
F13BP05160 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
F13BP05160 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
F13BP05160 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
F13BP05160 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
F13BP05160 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
F13BP05160 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
F13BP05160 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
F13BP05160 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
F13BP05160 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
F13BP05160 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
F13BP05160 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
F13BP05160 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
F13BP05160 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
F13BP05160 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
F13BP05160 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
F13BP05160 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
F13BP05160 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
F13BP05160 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
F13BP05160 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
F13BP05160 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
F13BP05160 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
F13BP05160 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
F13BP05160 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
F13BP05160 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
F13BP05160 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
F13BP05160 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
F13BP05160 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
F13BP05160 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
F13BP05160 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
F13BP05160 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
F13BP05160 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
F13BP05160 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
F13BP05160 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
F13BP05160 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
F13BP05160 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
F13BP05160 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
F13BP05160 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
F13BP05160 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
F13BP05160 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
F13BP05160 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
F13BP05160 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
F13BP05160 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
F13BP05160 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
F13BP05160 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
F13BP05160 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
F13BP05160 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
F13BP05160 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
F13BP05160 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
F13BP05160 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
F13BP05160 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
F13BP05160 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
F13BP05160 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
F13BP05160 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
F13BP05160 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
F13BP05160 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
F13BP05160 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
F13BP05160 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
F13BP05160 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
F13BP05160 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
F13BP05160 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
F13BP05160 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
F13BP05160 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
F13BP05160 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
F13BP05160 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
F13BP05160 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
F13BP05160 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
F13BP05160 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
F13BP05160 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
F13BP05160 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
F13BP05160 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
F13BP05160 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
F13BP05160 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
F13BP05160 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
F13BP05160 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
F13BP05160 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
F13BP05160 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
F13BP05160 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
F13BP05160 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
F13BP05160 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
F13BP05160 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
F13BP05160 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
F13BP05160 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
F13BP05160 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
F13BP05160 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
F13BP05160 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
F13BP05160 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
F13BP05160 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
F13BP05160 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
F13BP05160 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
F13BP05160 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
F13BP05160 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
F13BP05160 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
F13BP05160 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
F13BP05160 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms