Protein–RNA interactions for Protein: O95562

SFT2D2, Vesicle transport protein SFT2B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D2O95562 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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SFT2D2O95562 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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SFT2D2O95562 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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SFT2D2O95562 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SFT2D2O95562 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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