Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PPFIA4O75335 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PPFIA4O75335 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
PPFIA4O75335 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PPFIA4O75335 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms