Protein–RNA interactions for Protein: O60830

TIMM17B, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17-B, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17BO60830 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
TIMM17BO60830 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms