Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK85

DKKL1, Dickkopf-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKKL1Q9UK85 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DKKL1Q9UK85 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms