Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CENPJQ9HC77 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms