Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CEP44Q9C0F1 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP44Q9C0F1 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms