Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT8

TUBGCP5, Gamma-tubulin complex component 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP5Q96RT8 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TUBGCP5Q96RT8 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms