Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC06

ACBD4, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACBD4Q8NC06 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACBD4Q8NC06 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms