Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX29P2Q8IUI4 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SNX29P2Q8IUI4 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms