Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 A1CF-203ENST00000373995 2211 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 FUBP1-202ENST00000370767 2524 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ANKRD39Q53RE8 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms