Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LINC00303Q3SY05 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00303Q3SY05 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms