Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RUNX3Q13761 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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