Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FANCCQ00597 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FANCCQ00597 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms