Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CD40LGP29965 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CD40LGP29965 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms