Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5I7

CLDN16, Claudin-16, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN16Q9Y5I7 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN16Q9Y5I7 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms