Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RCE1Q9Y256 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RCE1Q9Y256 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms