Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRP68Q9UHB9 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms