Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms