Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RRP7BPQ9NSQ0 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RRP7BPQ9NSQ0 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms