Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRIP1Q9BX63 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms