Protein–RNA interactions for Protein: Q99928

GABRG3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRG3Q99928 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABRG3Q99928 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABRG3Q99928 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABRG3Q99928 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABRG3Q99928 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABRG3Q99928 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABRG3Q99928 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABRG3Q99928 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABRG3Q99928 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABRG3Q99928 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABRG3Q99928 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABRG3Q99928 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABRG3Q99928 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABRG3Q99928 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GABRG3Q99928 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABRG3Q99928 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABRG3Q99928 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABRG3Q99928 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABRG3Q99928 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GABRG3Q99928 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABRG3Q99928 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABRG3Q99928 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABRG3Q99928 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABRG3Q99928 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABRG3Q99928 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GABRG3Q99928 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GABRG3Q99928 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GABRG3Q99928 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GABRG3Q99928 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GABRG3Q99928 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABRG3Q99928 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABRG3Q99928 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABRG3Q99928 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABRG3Q99928 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GABRG3Q99928 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABRG3Q99928 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABRG3Q99928 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABRG3Q99928 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABRG3Q99928 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABRG3Q99928 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABRG3Q99928 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABRG3Q99928 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABRG3Q99928 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABRG3Q99928 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABRG3Q99928 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABRG3Q99928 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GABRG3Q99928 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRG3Q99928 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRG3Q99928 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRG3Q99928 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRG3Q99928 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRG3Q99928 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRG3Q99928 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRG3Q99928 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRG3Q99928 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRG3Q99928 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRG3Q99928 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRG3Q99928 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRG3Q99928 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRG3Q99928 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRG3Q99928 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRG3Q99928 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRG3Q99928 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRG3Q99928 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRG3Q99928 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRG3Q99928 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRG3Q99928 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRG3Q99928 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRG3Q99928 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRG3Q99928 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRG3Q99928 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRG3Q99928 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRG3Q99928 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRG3Q99928 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRG3Q99928 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRG3Q99928 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRG3Q99928 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRG3Q99928 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRG3Q99928 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRG3Q99928 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRG3Q99928 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRG3Q99928 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRG3Q99928 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GABRG3Q99928 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GABRG3Q99928 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GABRG3Q99928 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GABRG3Q99928 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GABRG3Q99928 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GABRG3Q99928 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABRG3Q99928 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABRG3Q99928 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABRG3Q99928 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABRG3Q99928 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABRG3Q99928 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABRG3Q99928 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABRG3Q99928 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABRG3Q99928 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABRG3Q99928 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GABRG3Q99928 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GABRG3Q99928 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms