Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHZ7

MBD3L2, Methyl-CpG-binding domain protein 3-like 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3L2Q8NHZ7 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD3L2Q8NHZ7 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MBD3L2Q8NHZ7 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms