Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3V4

UBE3B, Ubiquitin-protein ligase E3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3BQ7Z3V4 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE3BQ7Z3V4 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms