Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf17Q53FE4 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms