Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.52e-8■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.442e-8■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.42e-8■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC12.92□□□□□ -0.342e-8■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 APOBEC3C-202ENST00000428892 1056 ntTSL 310.75□□□□□ -0.691e-10■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 PCBP2-208ENST00000546652 823 ntTSL 511.45□□□□□ -0.586e-13■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 PCBP2-226ENST00000562264 1145 ntTSL 510.81□□□□□ -0.686e-13■□□□□ 11.3
ILF3Q12906 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.762e-9■□□□□ 11.2
ILF3Q12906 UGDH-208ENST00000510490 534 ntTSL 419.26■□□□□ 0.672e-9■□□□□ 11.2
ILF3Q12906 UGDH-211ENST00000515021 861 ntTSL 518.52■□□□□ 0.562e-9■□□□□ 11.2
ILF3Q12906 PACS1-208ENST00000529677 679 ntTSL 316.44■□□□□ 0.221e-14■□□□□ 11.2
ILF3Q12906 UGDH-203ENST00000503779 575 ntTSL 416.2■□□□□ 0.182e-9■□□□□ 11.2
ILF3Q12906 UGDH-207ENST00000509391 577 ntTSL 316.2■□□□□ 0.182e-9■□□□□ 11.2
ILF3Q12906 UGDH-210ENST00000514106 568 ntTSL 415.91■□□□□ 0.142e-9■□□□□ 11.2
ILF3Q12906 UGDH-212ENST00000515398 584 ntTSL 515.91■□□□□ 0.142e-9■□□□□ 11.2
ILF3Q12906 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.091e-11■□□□□ 11.2
ILF3Q12906 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.022e-9■□□□□ 11.2
ILF3Q12906 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.132e-9■□□□□ 11.2
ILF3Q12906 UGDH-205ENST00000506179 3021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.392e-9■□□□□ 11.2
ILF3Q12906 UGDH-204ENST00000505698 433 ntTSL 44.88□□□□□ -1.632e-9■□□□□ 11.2
ILF3Q12906 UGDH-209ENST00000510881 549 ntTSL 34.74□□□□□ -1.652e-9■□□□□ 11.2
ILF3Q12906 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.071e-6■□□□□ 11.2
ILF3Q12906 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.131e-6■□□□□ 11.2
ILF3Q12906 ZC3H7A-211ENST00000574995 532 ntTSL 425.63■■□□□ 1.693e-6■□□□□ 11.2
ILF3Q12906 ZC3H7A-208ENST00000572781 564 ntTSL 416.22■□□□□ 0.193e-6■□□□□ 11.2
ILF3Q12906 ZC3H7A-213ENST00000575170 831 ntTSL 315.17■□□□□ 0.023e-6■□□□□ 11.2
ILF3Q12906 ZC3H7A-205ENST00000571198 2343 ntTSL 214.55□□□□□ -0.083e-6■□□□□ 11.2
ILF3Q12906 ZC3H7A-216ENST00000576018 575 ntTSL 414.53□□□□□ -0.083e-6■□□□□ 11.2
ILF3Q12906 ZC3H7A-201ENST00000355758 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.973e-6■□□□□ 11.2
ILF3Q12906 SRCAP-202ENST00000395059 9126 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.665e-11■□□□□ 11.2
ILF3Q12906 AC106886.5-201ENST00000380361 11692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.175e-11■□□□□ 11.2
ILF3Q12906 PABPC1L-207ENST00000372824 2223 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.412e-13■□□□□ 11.2
ILF3Q12906 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.112e-6■□□□□ 11.2
ILF3Q12906 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.154e-7■□□□□ 11.2
ILF3Q12906 ZNF587-201ENST00000339656 6882 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.71e-9■□□□□ 11.2
ILF3Q12906 PKM-217ENST00000566809 560 ntTSL 420■□□□□ 0.793e-10■□□□□ 11.2
ILF3Q12906 PIEZO1-212ENST00000497793 1228 ntTSL 218.69■□□□□ 0.583e-10■□□□□ 11.2
ILF3Q12906 PKM-218ENST00000567087 550 ntTSL 418.48■□□□□ 0.553e-10■□□□□ 11.2
ILF3Q12906 PKM-223ENST00000569050 457 ntTSL 416.92■□□□□ 0.33e-10■□□□□ 11.2
ILF3Q12906 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.234e-7■□□□□ 11.2
ILF3Q12906 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.084e-7■□□□□ 11.2
ILF3Q12906 CLIC1-209ENST00000395892 1197 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.354e-7■□□□□ 11.2
ILF3Q12906 CLIC1-207ENST00000375780 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.514e-7■□□□□ 11.2
ILF3Q12906 CLIC1-210ENST00000616760 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.874e-7■□□□□ 11.2
ILF3Q12906 PKM-211ENST00000564276 753 ntTSL 1 (best)8.76□□□□□ -1.013e-10■□□□□ 11.2
ILF3Q12906 PVT1-210ENST00000521122 221 ntTSL 38.67□□□□□ -1.023e-10■□□□□ 11.2
ILF3Q12906 SEMA4G-211ENST00000521006 4656 ntTSL 1 (best)13.14□□□□□ -0.312e-6■□□□□ 11.2
ILF3Q12906 SEMA4G-205ENST00000517724 2675 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.742e-6■□□□□ 11.2
ILF3Q12906 SEMA4G-202ENST00000370250 3596 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.882e-6■□□□□ 11.2
ILF3Q12906 SEMA4G-201ENST00000210633 4094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.892e-6■□□□□ 11.2
ILF3Q12906 AP3D1-209ENST00000591284 580 ntTSL 519.14■□□□□ 0.656e-8■□□□□ 11.2
ILF3Q12906 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.226e-8■□□□□ 11.2
ILF3Q12906 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.186e-8■□□□□ 11.2
ILF3Q12906 MRE11-201ENST00000323929 6897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.217e-7■□□□□ 11.2
ILF3Q12906 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.447e-7■□□□□ 11.2
ILF3Q12906 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.517e-7■□□□□ 11.2
ILF3Q12906 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.77e-7■□□□□ 11.2
ILF3Q12906 UTRN-208ENST00000433557 354 ntTSL 421.81■■□□□ 1.082e-6■□□□□ 11.1
ILF3Q12906 ELOVL6-201ENST00000302274 3090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.491e-7■□□□□ 11.1
ILF3Q12906 ELOVL6-205ENST00000506625 610 ntTSL 49.62□□□□□ -0.871e-7■□□□□ 11.1
ILF3Q12906 ELOVL6-204ENST00000506461 575 ntTSL 48.63□□□□□ -1.031e-7■□□□□ 11.1
ILF3Q12906 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.411e-7■□□□□ 11.1
ILF3Q12906 ELOVL6-203ENST00000503885 458 ntTSL 45.1□□□□□ -1.591e-7■□□□□ 11.1
ILF3Q12906 ELOVL6-208ENST00000514184 607 ntTSL 33.55□□□□□ -1.841e-7■□□□□ 11.1
ILF3Q12906 DVL3-205ENST00000462665 668 ntTSL 522.73■■□□□ 1.232e-6■□□□□ 11.1
ILF3Q12906 DVL3-204ENST00000435708 559 ntTSL 522.57■■□□□ 1.22e-6■□□□□ 11.1
ILF3Q12906 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.062e-6■□□□□ 11.1
ILF3Q12906 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.622e-6■□□□□ 11.1
ILF3Q12906 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.592e-6■□□□□ 11.1
ILF3Q12906 DVL3-202ENST00000423300 1099 ntTSL 518.73■□□□□ 0.592e-6■□□□□ 11.1
ILF3Q12906 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.332e-6■□□□□ 11.1
ILF3Q12906 ATN1-203ENST00000537488 899 ntTSL 216.28■□□□□ 0.22e-6■□□□□ 11.1
ILF3Q12906 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.132e-6■□□□□ 11.1
ILF3Q12906 RAB5C-205ENST00000550013 555 ntTSL 215.4■□□□□ 0.062e-6■□□□□ 11.1
ILF3Q12906 RAB5C-206ENST00000550406 500 ntTSL 312.81□□□□□ -0.362e-6■□□□□ 11.1
ILF3Q12906 ATXN7L1-209ENST00000481880 870 ntTSL 212.29□□□□□ -0.442e-6■□□□□ 11.1
ILF3Q12906 TIMM50-206ENST00000595961 2576 ntTSL 212.28□□□□□ -0.442e-9■□□□□ 11.1
ILF3Q12906 RAB5C-204ENST00000547517 1167 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.532e-6■□□□□ 11.1
ILF3Q12906 RAB5C-203ENST00000546881 608 ntTSL 211.48□□□□□ -0.572e-6■□□□□ 11.1
ILF3Q12906 ATXN7L1-202ENST00000419735 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.932e-6■□□□□ 11.1
ILF3Q12906 ATXN7L1-201ENST00000318724 1470 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.962e-6■□□□□ 11.1
ILF3Q12906 ATXN7L1-208ENST00000478915 1115 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.972e-6■□□□□ 11.1
ILF3Q12906 TBC1D16-204ENST00000571872 567 ntTSL 517.3■□□□□ 0.362e-6■□□□□ 11.1
ILF3Q12906 TBC1D16-201ENST00000310924 10936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.612e-6■□□□□ 11.1
ILF3Q12906 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.032e-6■□□□□ 11.1
ILF3Q12906 TNFRSF10B-207ENST00000523504 1464 ntTSL 221.19■□□□□ 0.982e-6■□□□□ 11.1
ILF3Q12906 TNFRSF10B-201ENST00000276431 4146 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.732e-6■□□□□ 11.1
ILF3Q12906 RBM4-202ENST00000396053 1337 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.423e-6■□□□□ 11.1
ILF3Q12906 COPE-208ENST00000598969 1770 ntTSL 520.39■□□□□ 0.855e-6■□□□□ 11.1
ILF3Q12906 COPE-204ENST00000593827 601 ntTSL 320.01■□□□□ 0.795e-6■□□□□ 11.1
ILF3Q12906 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.565e-6■□□□□ 11.1
ILF3Q12906 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.525e-6■□□□□ 11.1
ILF3Q12906 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.345e-6■□□□□ 11.1
ILF3Q12906 COPE-206ENST00000597026 678 ntTSL 216.01■□□□□ 0.155e-6■□□□□ 11.1
ILF3Q12906 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.115e-6■□□□□ 11.1
ILF3Q12906 AC002985.1-202ENST00000593484 584 ntAPPRIS P1 TSL 513.7□□□□□ -0.225e-6■□□□□ 11.1
ILF3Q12906 AC002985.1-201ENST00000596918 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.315e-6■□□□□ 11.1
ILF3Q12906 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.447e-17■□□□□ 11.1
ILF3Q12906 CRTAP-201ENST00000320954 6630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.537e-17■□□□□ 11.1
ILF3Q12906 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.137e-8■□□□□ 11.1
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