Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HOXD12P35452 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms