Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C4AP0C0L4 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4AP0C0L4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4AP0C0L4 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4AP0C0L4 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4AP0C0L4 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4AP0C0L4 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4AP0C0L4 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4AP0C0L4 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4AP0C0L4 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4AP0C0L4 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4AP0C0L4 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4AP0C0L4 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4AP0C0L4 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4AP0C0L4 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4AP0C0L4 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4AP0C0L4 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4AP0C0L4 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4AP0C0L4 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C4AP0C0L4 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4AP0C0L4 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4AP0C0L4 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4AP0C0L4 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4AP0C0L4 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C4AP0C0L4 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4AP0C0L4 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4AP0C0L4 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4AP0C0L4 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4AP0C0L4 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4AP0C0L4 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4AP0C0L4 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C4AP0C0L4 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C4AP0C0L4 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C4AP0C0L4 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C4AP0C0L4 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C4AP0C0L4 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C4AP0C0L4 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
C4AP0C0L4 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C4AP0C0L4 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C4AP0C0L4 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C4AP0C0L4 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C4AP0C0L4 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C4AP0C0L4 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C4AP0C0L4 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C4AP0C0L4 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
C4AP0C0L4 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
C4AP0C0L4 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
C4AP0C0L4 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
C4AP0C0L4 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C4AP0C0L4 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C4AP0C0L4 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C4AP0C0L4 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C4AP0C0L4 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
C4AP0C0L4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C4AP0C0L4 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C4AP0C0L4 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C4AP0C0L4 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C4AP0C0L4 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C4AP0C0L4 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C4AP0C0L4 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C4AP0C0L4 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C4AP0C0L4 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C4AP0C0L4 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C4AP0C0L4 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C4AP0C0L4 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
C4AP0C0L4 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C4AP0C0L4 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C4AP0C0L4 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C4AP0C0L4 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C4AP0C0L4 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C4AP0C0L4 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C4AP0C0L4 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C4AP0C0L4 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C4AP0C0L4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C4AP0C0L4 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C4AP0C0L4 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
C4AP0C0L4 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C4AP0C0L4 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C4AP0C0L4 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C4AP0C0L4 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C4AP0C0L4 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
C4AP0C0L4 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C4AP0C0L4 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
C4AP0C0L4 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C4AP0C0L4 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C4AP0C0L4 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C4AP0C0L4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C4AP0C0L4 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C4AP0C0L4 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C4AP0C0L4 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C4AP0C0L4 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C4AP0C0L4 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C4AP0C0L4 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C4AP0C0L4 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C4AP0C0L4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C4AP0C0L4 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C4AP0C0L4 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C4AP0C0L4 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C4AP0C0L4 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C4AP0C0L4 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms