Protein–RNA interactions for Protein: O95471

CLDN7, Claudin-7, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN7O95471 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CLDN7O95471 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms