Protein–RNA interactions for Protein: O43772

SLC25A20, Mitochondrial carnitine/acylcarnitine carrier protein, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A20O43772 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SLC25A20O43772 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SLC25A20O43772 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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