Protein–RNA interactions for Protein: A6NI47

POTEM, Putative POTE ankyrin domain family member M, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEMA6NI47 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
POTEMA6NI47 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms