Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HDGFL3Q9Y3E1 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HDGFL3Q9Y3E1 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms