Protein–RNA interactions for Protein: Q99962

SH3GL2, Endophilin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL2Q99962 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SH3GL2Q99962 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms