Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
RNF185Q96GF1 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms