Protein–RNA interactions for Protein: Q96G79

SLC35A4, Probable UDP-sugar transporter protein SLC35A4, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A4Q96G79 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms