Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NKD1Q969G9 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NKD1Q969G9 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NKD1Q969G9 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NKD1Q969G9 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NKD1Q969G9 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NKD1Q969G9 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NKD1Q969G9 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NKD1Q969G9 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NKD1Q969G9 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NKD1Q969G9 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NKD1Q969G9 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NKD1Q969G9 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NKD1Q969G9 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NKD1Q969G9 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NKD1Q969G9 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NKD1Q969G9 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NKD1Q969G9 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NKD1Q969G9 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NKD1Q969G9 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NKD1Q969G9 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NKD1Q969G9 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NKD1Q969G9 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NKD1Q969G9 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NKD1Q969G9 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NKD1Q969G9 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NKD1Q969G9 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NKD1Q969G9 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NKD1Q969G9 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NKD1Q969G9 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NKD1Q969G9 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NKD1Q969G9 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NKD1Q969G9 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NKD1Q969G9 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NKD1Q969G9 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NKD1Q969G9 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NKD1Q969G9 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NKD1Q969G9 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NKD1Q969G9 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NKD1Q969G9 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NKD1Q969G9 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NKD1Q969G9 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NKD1Q969G9 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NKD1Q969G9 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NKD1Q969G9 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NKD1Q969G9 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NKD1Q969G9 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NKD1Q969G9 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NKD1Q969G9 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NKD1Q969G9 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NKD1Q969G9 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NKD1Q969G9 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NKD1Q969G9 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NKD1Q969G9 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NKD1Q969G9 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKD1Q969G9 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKD1Q969G9 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKD1Q969G9 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKD1Q969G9 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKD1Q969G9 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKD1Q969G9 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKD1Q969G9 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKD1Q969G9 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKD1Q969G9 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKD1Q969G9 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKD1Q969G9 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKD1Q969G9 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKD1Q969G9 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKD1Q969G9 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKD1Q969G9 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKD1Q969G9 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKD1Q969G9 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NKD1Q969G9 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKD1Q969G9 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKD1Q969G9 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKD1Q969G9 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKD1Q969G9 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKD1Q969G9 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKD1Q969G9 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKD1Q969G9 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKD1Q969G9 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKD1Q969G9 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKD1Q969G9 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKD1Q969G9 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NKD1Q969G9 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NKD1Q969G9 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NKD1Q969G9 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NKD1Q969G9 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NKD1Q969G9 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NKD1Q969G9 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NKD1Q969G9 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms