Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PRAMEF20Q5VT98 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms