Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SAPCD1Q5SSQ6 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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SAPCD1Q5SSQ6 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SAPCD1Q5SSQ6 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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