Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms