Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CXCL3P19876 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CXCL3P19876 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms