Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F3O00716 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F3O00716 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F3O00716 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F3O00716 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F3O00716 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F3O00716 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F3O00716 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F3O00716 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F3O00716 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F3O00716 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F3O00716 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F3O00716 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F3O00716 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F3O00716 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F3O00716 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F3O00716 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F3O00716 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F3O00716 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F3O00716 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F3O00716 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F3O00716 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F3O00716 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F3O00716 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F3O00716 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
E2F3O00716 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
E2F3O00716 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
E2F3O00716 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
E2F3O00716 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
E2F3O00716 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
E2F3O00716 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
E2F3O00716 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
E2F3O00716 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
E2F3O00716 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
E2F3O00716 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
E2F3O00716 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
E2F3O00716 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
E2F3O00716 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
E2F3O00716 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F3O00716 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F3O00716 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F3O00716 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F3O00716 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F3O00716 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F3O00716 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F3O00716 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F3O00716 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F3O00716 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F3O00716 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F3O00716 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F3O00716 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F3O00716 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F3O00716 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F3O00716 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F3O00716 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F3O00716 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F3O00716 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F3O00716 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F3O00716 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F3O00716 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F3O00716 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F3O00716 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F3O00716 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F3O00716 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F3O00716 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F3O00716 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F3O00716 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F3O00716 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F3O00716 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F3O00716 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F3O00716 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F3O00716 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F3O00716 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F3O00716 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F3O00716 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F3O00716 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F3O00716 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F3O00716 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F3O00716 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F3O00716 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F3O00716 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F3O00716 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F3O00716 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F3O00716 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F3O00716 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F3O00716 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F3O00716 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F3O00716 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F3O00716 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F3O00716 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F3O00716 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F3O00716 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F3O00716 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F3O00716 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F3O00716 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F3O00716 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F3O00716 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F3O00716 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F3O00716 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F3O00716 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms