Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.292e-8■■■■■ 153.7
UTP3Q9NQZ2 ACACA-243ENST00000618575 772 ntTSL 410.59□□□□□ -0.717e-7■■■■■ 153.7
UTP3Q9NQZ2 RERE-213ENST00000480342 2710 ntTSL 210.74□□□□□ -0.691e-6■■■■■ 153.7
UTP3Q9NQZ2 INPPL1-204ENST00000537656 550 ntTSL 213.03□□□□□ -0.329e-10■■■■■ 153.5
UTP3Q9NQZ2 NPRL3-210ENST00000610509 2917 ntTSL 214.25□□□□□ -0.133e-6■■■■■ 153.5
UTP3Q9NQZ2 TBC1D5-223ENST00000471679 435 ntTSL 425.01■■□□□ 1.591e-13■■■■■ 153.4
UTP3Q9NQZ2 GLG1-213ENST00000567951 2918 ntTSL 1 (best)19.87■□□□□ 0.773e-6■■■■■ 153.4
UTP3Q9NQZ2 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.553e-6■■■■■ 153.4
UTP3Q9NQZ2 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.253e-6■■■■■ 153.4
UTP3Q9NQZ2 GLG1-206ENST00000562090 4037 ntTSL 215.73■□□□□ 0.113e-6■■■■■ 153.4
UTP3Q9NQZ2 HCFC1-203ENST00000444191 3624 ntTSL 512.96□□□□□ -0.333e-7■■■■■ 153.4
UTP3Q9NQZ2 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.281e-6■■■■■ 153.3
UTP3Q9NQZ2 SNX17-203ENST00000440760 1955 ntTSL 1 (best)20.74■□□□□ 0.913e-7■■■■■ 153.3
UTP3Q9NQZ2 SNX17-202ENST00000427123 2007 ntTSL 220.73■□□□□ 0.913e-7■■■■■ 153.3
UTP3Q9NQZ2 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.823e-7■■■■■ 153.3
UTP3Q9NQZ2 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.643e-7■■■■■ 153.3
UTP3Q9NQZ2 SNX17-204ENST00000453453 1638 ntTSL 1 (best)16.89■□□□□ 0.293e-7■■■■■ 153.3
UTP3Q9NQZ2 SSBP3-207ENST00000426150 851 ntTSL 39.92□□□□□ -0.821e-6■■■■■ 153.3
UTP3Q9NQZ2 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.712e-6■■■■■ 153.2
UTP3Q9NQZ2 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.512e-6■■■■■ 153.2
UTP3Q9NQZ2 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.462e-6■■■■■ 153.2
UTP3Q9NQZ2 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.42e-6■■■■■ 153.2
UTP3Q9NQZ2 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.242e-6■■■■■ 153.2
UTP3Q9NQZ2 MAGI1-217ENST00000611645 6398 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.142e-6■■■■■ 153.2
UTP3Q9NQZ2 MAGI1-203ENST00000460329 3694 ntTSL 515.42■□□□□ 0.062e-6■■■■■ 153.2
UTP3Q9NQZ2 MAGI1-204ENST00000463103 4193 ntTSL 514.56□□□□□ -0.082e-6■■■■■ 153.2
UTP3Q9NQZ2 TULP4-206ENST00000616856 2307 ntTSL 213.26□□□□□ -0.292e-6■■■■■ 153.2
UTP3Q9NQZ2 BCAT2-205ENST00000595376 2254 ntTSL 219.31■□□□□ 0.685e-8■■■■■ 153.2
UTP3Q9NQZ2 BCAT2-212ENST00000601681 1016 ntTSL 1 (best)16.07■□□□□ 0.165e-8■■■■■ 153.2
UTP3Q9NQZ2 ZBTB21-203ENST00000398499 5806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.731e-6■■■■■ 153.2
UTP3Q9NQZ2 ZBTB21-204ENST00000398505 6846 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.061e-6■■■■■ 153.2
UTP3Q9NQZ2 ZBTB21-205ENST00000398511 5608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.221e-6■■■■■ 153.2
UTP3Q9NQZ2 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.521e-6■■■■■ 153.2
UTP3Q9NQZ2 TEX264-213ENST00000489026 800 ntTSL 216.81■□□□□ 0.281e-6■■■■■ 153.2
UTP3Q9NQZ2 TEX264-214ENST00000493444 554 ntTSL 310.47□□□□□ -0.731e-6■■■■■ 153.2
UTP3Q9NQZ2 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.463e-7■■■■■ 153.1
UTP3Q9NQZ2 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.433e-7■■■■■ 153.1
UTP3Q9NQZ2 TUBGCP2-210ENST00000543663 4302 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.063e-7■■■■■ 153.1
UTP3Q9NQZ2 TUBGCP2-208ENST00000482278 3553 ntTSL 212.82□□□□□ -0.363e-7■■■■■ 153.1
UTP3Q9NQZ2 TUBGCP2-201ENST00000252936 3885 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.383e-7■■■■■ 153.1
UTP3Q9NQZ2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.915e-7■■■■■ 153.1
UTP3Q9NQZ2 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.255e-7■■■■■ 153.1
UTP3Q9NQZ2 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.785e-8■■■■■ 153.1
UTP3Q9NQZ2 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.445e-8■■■■■ 153.1
UTP3Q9NQZ2 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.35e-7■■■■■ 153
UTP3Q9NQZ2 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.265e-7■■■■■ 153
UTP3Q9NQZ2 RALGDS-213ENST00000493438 4602 ntTSL 216.52■□□□□ 0.235e-7■■■■■ 153
UTP3Q9NQZ2 P4HB-208ENST00000473021 914 ntTSL 1 (best)17.06■□□□□ 0.322e-7■■■■■ 153
UTP3Q9NQZ2 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.152e-6■■■■■ 153
UTP3Q9NQZ2 FAN1-206ENST00000565280 4999 ntTSL 1 (best)15.95■□□□□ 0.142e-9■■■■■ 152.9
UTP3Q9NQZ2 FAN1-201ENST00000362065 4891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.152e-9■■■■■ 152.9
UTP3Q9NQZ2 XRRA1-213ENST00000530562 2339 ntTSL 213.85□□□□□ -0.196e-15■■■■■ 152.9
UTP3Q9NQZ2 FGFR3-209ENST00000507588 336 ntTSL 1 (best)19.78■□□□□ 0.763e-11■■■■■ 152.9
UTP3Q9NQZ2 VPS8-227ENST00000625842 4969 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.254e-8■■■■■ 152.9
UTP3Q9NQZ2 VPS8-207ENST00000436792 5011 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.634e-8■■■■■ 152.9
UTP3Q9NQZ2 VPS8-210ENST00000446204 4721 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.994e-8■■■■■ 152.9
UTP3Q9NQZ2 VPS8-201ENST00000287546 5047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.064e-8■■■■■ 152.9
UTP3Q9NQZ2 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.893e-7■■■■■ 152.8
UTP3Q9NQZ2 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.883e-7■■■■■ 152.8
UTP3Q9NQZ2 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.653e-7■■■■■ 152.8
UTP3Q9NQZ2 RCOR3-211ENST00000528926 1497 ntTSL 214.53□□□□□ -0.086e-8■■■■■ 152.8
UTP3Q9NQZ2 YES1-203ENST00000577961 4554 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.024e-13■■■■■ 152.8
UTP3Q9NQZ2 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.342e-6■■■■■ 152.7
UTP3Q9NQZ2 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.232e-6■■■■■ 152.7
UTP3Q9NQZ2 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.052e-6■■■■■ 152.7
UTP3Q9NQZ2 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.054e-9■■■■■ 152.7
UTP3Q9NQZ2 MANBA-201ENST00000226578 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.394e-9■■■■■ 152.7
UTP3Q9NQZ2 MANBA-207ENST00000514430 7444 ntTSL 29.51□□□□□ -0.894e-9■■■■■ 152.7
UTP3Q9NQZ2 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.072e-8■■■■■ 152.7
UTP3Q9NQZ2 AGAP1-212ENST00000614409 9932 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.291e-6■■■■■ 152.7
UTP3Q9NQZ2 AGAP1-207ENST00000428334 10090 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.451e-6■■■■■ 152.7
UTP3Q9NQZ2 FARSA-209ENST00000592662 864 ntTSL 1 (best)20.3■□□□□ 0.842e-6■■■■■ 152.7
UTP3Q9NQZ2 FARSA-210ENST00000593021 1135 ntTSL 520.1■□□□□ 0.812e-6■■■■■ 152.7
UTP3Q9NQZ2 FARSA-204ENST00000586280 803 ntTSL 313.86□□□□□ -0.192e-6■■■■■ 152.7
UTP3Q9NQZ2 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.111e-6■■■■■ 152.6
UTP3Q9NQZ2 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.086e-7■■■■■ 152.6
UTP3Q9NQZ2 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.36e-7■■■■■ 152.6
UTP3Q9NQZ2 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.616e-7■■■■■ 152.5
UTP3Q9NQZ2 RCC1-209ENST00000430407 1121 ntTSL 518.73■□□□□ 0.596e-7■■■■■ 152.5
UTP3Q9NQZ2 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.16e-7■■■■■ 152.5
UTP3Q9NQZ2 RCC1-205ENST00000411533 1169 ntTSL 515.33■□□□□ 0.046e-7■■■■■ 152.5
UTP3Q9NQZ2 DENND4B-211ENST00000492898 951 ntTSL 513.34□□□□□ -0.273e-6■■■■■ 152.5
UTP3Q9NQZ2 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.322e-6■■■■■ 152.4
UTP3Q9NQZ2 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.152e-6■■■■■ 152.4
UTP3Q9NQZ2 TULP4-201ENST00000367094 5170 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.482e-6■■■■■ 152.4
UTP3Q9NQZ2 TULP4-202ENST00000367097 11295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.712e-6■■■■■ 152.4
UTP3Q9NQZ2 TBC1D7-214ENST00000606214 2229 ntAPPRIS P1 TSL 513.45□□□□□ -0.269e-7■■■■■ 152.3
UTP3Q9NQZ2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.078e-9■■■■■ 152.3
UTP3Q9NQZ2 DNPEP-204ENST00000373966 1875 ntTSL 523.33■■□□□ 1.338e-9■■■■■ 152.3
UTP3Q9NQZ2 DNPEP-203ENST00000373963 1657 ntTSL 521.06■□□□□ 0.968e-9■■■■■ 152.3
UTP3Q9NQZ2 DNPEP-220ENST00000523282 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.168e-9■■■■■ 152.3
UTP3Q9NQZ2 DNPEP-205ENST00000373972 1578 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.238e-9■■■■■ 152.3
UTP3Q9NQZ2 DNPEP-214ENST00000490371 555 ntTSL 513.35□□□□□ -0.278e-9■■■■■ 152.3
UTP3Q9NQZ2 AGAP3-221ENST00000490097 604 ntTSL 416.48■□□□□ 0.236e-7■■■■■ 152.3
UTP3Q9NQZ2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.922e-6■■■■■ 152.2
UTP3Q9NQZ2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.922e-6■■■■■ 152.2
UTP3Q9NQZ2 ZNRF1-203ENST00000564320 607 ntTSL 39.07□□□□□ -0.964e-8■■■■■ 152.2
UTP3Q9NQZ2 ZNRF1-209ENST00000568511 485 ntTSL 48.97□□□□□ -0.974e-8■■■■■ 152.2
UTP3Q9NQZ2 ASPH-203ENST00000379454 5268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.174e-7■■■■■ 152.1
UTP3Q9NQZ2 SEC14L1-204ENST00000436233 5295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.028e-7■■■■■ 152.1
Retrieved 100 of 52,753 protein–RNA pairs in 1475.8 ms