Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ95

NSD3, Histone-lysine N-methyltransferase NSD3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD3Q9BZ95 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NSD3Q9BZ95 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NSD3Q9BZ95 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms