Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQN1

FAM83C, Protein FAM83C, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM83CQ9BQN1 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FAM83CQ9BQN1 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms