Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms