Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP2A3Q93084 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms