Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHG7

SVIP, Small VCP/p97-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVIPQ8NHG7 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 PITX2-202ENST00000354925 3359 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 TP53-209ENST00000504937 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 TP53-224ENST00000619186 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 PDZRN3-208ENST00000479530 2778 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 NEDD9-201ENST00000379433 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 TMEM147-AS1-205ENST00000590717 3300 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 SMCR5-201ENST00000543475 2844 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 GOLGA3-201ENST00000204726 9252 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 AC002090.1-201ENST00000625000 2138 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 GPR156-202ENST00000461057 2525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 RTN3-208ENST00000537981 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 CAPN1-208ENST00000527323 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 AC018512.1-201ENST00000417761 2326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 EFCAB11-208ENST00000555872 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 RFX5-202ENST00000368870 2459 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 SYNJ2-204ENST00000367122 3029 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 SFPQ-201ENST00000357214 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 CA10-202ENST00000442502 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 CACNG3-201ENST00000005284 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 PCDHGC3-202ENST00000611950 2849 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 AC026992.2-203ENST00000563004 2419 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 GNL1-201ENST00000376621 7490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 SEPT9-204ENST00000427180 3635 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 ST3GAL5-204ENST00000393808 2236 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 SNIP1-201ENST00000296215 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 CMIP-203ENST00000539778 3937 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 TPM3-207ENST00000341372 2007 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SVIPQ8NHG7 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.5 ms